MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	AAAC	2	8	17	24	75 %	0 %	0 %	25 %	294679221
2	NT_167351	ATA	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679221
3	NT_167351	A	6	6	41	46	100 %	0 %	0 %	0 %	294679221
4	NT_167351	A	6	6	69	74	100 %	0 %	0 %	0 %	294679221
5	NT_167351	TTCA	2	8	116	123	25 %	50 %	0 %	25 %	294679221
6	NT_167351	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679221
7	NT_167351	AGC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679221
8	NT_167351	T	8	8	194	201	0 %	100 %	0 %	0 %	294679222
9	NT_167351	TAA	2	6	203	208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679222
10	NT_167351	CAA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679222
11	NT_167351	TGT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679223
12	NT_167351	T	6	6	1075	1080	0 %	100 %	0 %	0 %	294679223
13	NT_167351	AACAT	2	10	1143	1152	60 %	20 %	0 %	20 %	294679223
14	NT_167351	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
15	NT_167351	TACAAA	2	12	1473	1484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294679224
16	NT_167351	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
17	NT_167351	A	9	9	1544	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
18	NT_167351	CAAT	2	8	1555	1562	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
19	NT_167351	TCAA	2	8	1619	1626	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
20	NT_167351	ATT	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
21	NT_167351	A	6	6	1654	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
22	NT_167351	AAC	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
23	NT_167351	TAT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
24	NT_167351	CTA	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679224
25	NT_167351	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
26	NT_167351	A	7	7	1784	1790	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
27	NT_167351	TAA	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
28	NT_167351	GAG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679224
29	NT_167351	TAA	3	9	1873	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
30	NT_167351	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
31	NT_167351	AAG	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679224
32	NT_167351	AAAG	2	8	1908	1915	75 %	0 %	25 %	0 %	294679224
33	NT_167351	TAA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
34	NT_167351	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
35	NT_167351	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
36	NT_167351	CAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
37	NT_167351	TAT	2	6	1987	1992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679224
38	NT_167351	AAGAA	2	10	2005	2014	80 %	0 %	20 %	0 %	294679224
39	NT_167351	ACA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679224
40	NT_167351	A	6	6	2110	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
41	NT_167351	AAAT	2	8	2142	2149	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
42	NT_167351	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
43	NT_167351	AAAC	2	8	2218	2225	75 %	0 %	0 %	25 %	294679224
44	NT_167351	AG	3	6	2239	2244	50 %	0 %	50 %	0 %	294679224
45	NT_167351	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679224
46	NT_167351	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
47	NT_167351	AT	4	8	2340	2347	50 %	50 %	0 %	0 %	294679224
48	NT_167351	ATCAA	2	10	2373	2382	60 %	20 %	0 %	20 %	294679224
49	NT_167351	AAAT	2	8	2385	2392	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
50	NT_167351	CAAA	2	8	2422	2429	75 %	0 %	0 %	25 %	294679224
51	NT_167351	A	8	8	2427	2434	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
52	NT_167351	A	7	7	2444	2450	100 %	0 %	0 %	0 %	294679224
53	NT_167351	CAAT	2	8	2458	2465	50 %	25 %	0 %	25 %	294679224
54	NT_167351	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	294679224
55	NT_167351	A	9	9	2570	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
56	NT_167351	A	6	6	2618	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
57	NT_167351	AT	3	6	2645	2650	50 %	50 %	0 %	0 %	294679225
58	NT_167351	TA	3	6	2673	2678	50 %	50 %	0 %	0 %	294679225
59	NT_167351	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
60	NT_167351	A	8	8	2699	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
61	NT_167351	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679225
62	NT_167351	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
63	NT_167351	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
64	NT_167351	TATAT	2	10	2889	2898	40 %	60 %	0 %	0 %	294679225
65	NT_167351	AATTTA	2	12	2901	2912	50 %	50 %	0 %	0 %	294679225
66	NT_167351	GT	3	6	2922	2927	0 %	50 %	50 %	0 %	294679225
67	NT_167351	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
68	NT_167351	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
69	NT_167351	A	6	6	2967	2972	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
70	NT_167351	A	6	6	2978	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
71	NT_167351	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679225
72	NT_167351	AAG	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679225
73	NT_167351	GGA	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679225
74	NT_167351	TAAA	2	8	3072	3079	75 %	25 %	0 %	0 %	294679225
75	NT_167351	A	6	6	3087	3092	100 %	0 %	0 %	0 %	294679225
76	NT_167351	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679225
77	NT_167351	ATA	2	6	3340	3345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679226
78	NT_167351	ATT	2	6	3359	3364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679226
79	NT_167351	A	6	6	3384	3389	100 %	0 %	0 %	0 %	294679226
80	NT_167351	TAAA	2	8	3403	3410	75 %	25 %	0 %	0 %	294679226
81	NT_167351	TA	4	8	3758	3765	50 %	50 %	0 %	0 %	294679227
82	NT_167351	ATA	3	9	3763	3771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679227
83	NT_167351	ACATA	2	10	3800	3809	60 %	20 %	0 %	20 %	294679227
84	NT_167351	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	294679227
85	NT_167351	GTATGC	2	12	4279	4290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294679228
86	NT_167351	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
87	NT_167351	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
88	NT_167351	TAG	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679228
89	NT_167351	AAC	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294679228
90	NT_167351	CT	3	6	4416	4421	0 %	50 %	0 %	50 %	294679228
91	NT_167351	T	6	6	4474	4479	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
92	NT_167351	AAT	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
93	NT_167351	TTA	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
94	NT_167351	ACC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679228
95	NT_167351	T	6	6	4621	4626	0 %	100 %	0 %	0 %	294679228
96	NT_167351	TA	4	8	4653	4660	50 %	50 %	0 %	0 %	294679228
97	NT_167351	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679228
98	NT_167351	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679228
99	NT_167351	TTTCCA	2	12	4718	4729	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294679228
100	NT_167351	A	7	7	4737	4743	100 %	0 %	0 %	0 %	294679228
101	NT_167351	TTA	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679228
102	NT_167351	AT	3	6	4828	4833	50 %	50 %	0 %	0 %	294679228
103	NT_167351	ATT	3	9	5899	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
104	NT_167351	AATC	2	8	5913	5920	50 %	25 %	0 %	25 %	294679229
105	NT_167351	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679229
106	NT_167351	GAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679229
107	NT_167351	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	294679229
108	NT_167351	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679229
109	NT_167351	T	7	7	7129	7135	0 %	100 %	0 %	0 %	294679230
110	NT_167351	T	6	6	7172	7177	0 %	100 %	0 %	0 %	294679230
111	NT_167351	T	7	7	7389	7395	0 %	100 %	0 %	0 %	294679231
112	NT_167351	CCA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679231
113	NT_167351	ACCACA	2	12	7444	7455	50 %	0 %	0 %	50 %	294679231
114	NT_167351	GAA	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679231
115	NT_167351	AGAATG	2	12	7476	7487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294679231
116	NT_167351	GCT	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679232
117	NT_167351	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679232
118	NT_167351	AG	3	6	7651	7656	50 %	0 %	50 %	0 %	294679232
119	NT_167351	A	6	6	7682	7687	100 %	0 %	0 %	0 %	294679233
120	NT_167351	AGCTCA	2	12	7779	7790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294679233
121	NT_167351	ATG	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679234
122	NT_167351	A	6	6	8200	8205	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
123	NT_167351	AAG	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
124	NT_167351	A	7	7	8259	8265	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
125	NT_167351	TGA	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679235
126	NT_167351	A	7	7	8386	8392	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
127	NT_167351	A	8	8	8396	8403	100 %	0 %	0 %	0 %	294679235
128	NT_167351	AGA	2	6	8418	8423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679235
129	NT_167351	AT	3	6	8920	8925	50 %	50 %	0 %	0 %	294679236
130	NT_167351	TATT	2	8	9262	9269	25 %	75 %	0 %	0 %	294679237
131	NT_167351	T	6	6	9285	9290	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
132	NT_167351	GTT	2	6	9296	9301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679237
133	NT_167351	T	7	7	9307	9313	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
134	NT_167351	AAG	2	6	9327	9332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679237
135	NT_167351	CTT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679237
136	NT_167351	CTAAC	2	10	9386	9395	40 %	20 %	0 %	40 %	294679237
137	NT_167351	T	6	6	9432	9437	0 %	100 %	0 %	0 %	294679237
138	NT_167351	ATTAA	2	10	9445	9454	60 %	40 %	0 %	0 %	294679237
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140	NT_167351	TATT	2	8	9650	9657	25 %	75 %	0 %	0 %	294679237
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.